La misión del CFMA es promover el mejoramiento vegetal (MG) vegetal en Chile, para satisfacer la disponibilidad de materiales genéticos bien adaptados a las condiciones locales y para hacer de esta actividad un nuevo negocio que pueda traspasar las fronteras del país. En este empeño, el Comité promueve el desarrollo de capacidades humanas y técnicas, y el emprendimiento de iniciativas que permitan generar productos que contribuyan significativamente al incremento de la productividad y sostenibilidad de los ecosistemas agrícolas y forestales.